讲述一名园艺家宇航员坠毁在一颗荒凉的矮行星上，被困许久，当一个精灵到来后，曾经的独行侠发现了建立新生活的乐趣，并意识到宇宙已经提供了惊人的救赎。
正在调查坠落在太平洋上的不明飞行物体的海上自卫队二尉有动贵文（大澄贤也），遇到了突然出现的蓝光，受发光体的影响，导致遗传因子标准的变质，变成了凶恶的怪兽THE ONE。之后，他（THE ONE）从防卫厅内的特殊机关BCST（对生物工程学的研究机关）的监视下逃走，从此就没了音训。 另一方面，航空自卫队F15J飞行员真木舜一（别所哲也），为了多点时间陪伴患有先天性疾病的儿子继梦决定辞去官职。在最后一次飞行中真木与“红色发光体”在空中相遇。这是the one事件后3个月发生的事情。但是真木奇迹般地生还，然后转职成为了民航机飞行员，展开了新生活。对这样的真木还是有机关非常关注，尤其是BCST中的化学担当官水原沙罗，BCST将真木强制带走，在废工厂中搭建的BCST研究室进行身体上的监视。此时行踪不明的怪兽THE ONE像被某种东西吸引而回来了。遭受THE ONE攻击而濒死的真木，身体发生了变化，在红色光球的力量之下变身了！变成身高10M拥有银色光芒的钢铁身体型态，偶而还有自己意志的真木，跟THE ONE展开作战，但是因为变身不完全，能量快速消耗，在遭到决定性的一击后变回了真木舜一的型态。然后沙罗将这个在THE ONE之后出现的生命体定名为“THE NEXT”。 真木在从东京被护送回BCST研究室的途中得知了儿子继梦入院的消息,在赶到医院后跟妻子蓉子再次的碰面了。此时,人类最大的危机出现了,在吸收了各式各样的生物进入体内而产生变异的"THE ONE"重返出现在新宿的街道上,从口中发出的的超绝火炎光弹将街道烧毁殆尽有恸的人格已经被"THE ONE"取代,已经成为不能变回为人的状态。不过那样的有恸以前与水原沙罗却是有着婚约的情侣为了沙罗心中的回忆，并且为了跟儿子继梦的约定，为了保护心爱的家族，真木再次变身。那个姿态更加进化成巨大化40m，在间接部有像流血般的红色，两肘的特征是出现肘刀。现在，以新宿副市中心为舞台，ULTRAMAN与"THE ONE"的决战之火开始燃烧了！
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在前往纽约的途中，乔什和布鲁得到了史蒂夫和乔的帮助，但一个贪婪的男人密谋将大苹果据为己有，而他还没有学会分享，在布鲁的追捕下，她必须踏上冒险之旅，在为时已晚之前拯救她的朋友和纽约市。
艾略特（Mike Nawrocki 配音）、乔治（Phil Vischer 配音）和塞其维克在同一间餐厅打工，每天重复着日复一日的枯燥生活，它们感到自己的灵魂正在繁重的工作中慢慢死去。三人的心中都有着各自的英雄梦，它们都觉得自己不会在碌碌无为中了却此生，然而残酷的现实预示着，这恐怖噩梦的预想或许就要成真。
一望无垠的荒野，阒寂遥夐。在某个角落，一个用沙子堆成的人直挺挺地躺着，少顷，他仿佛有了生命一般，慢慢悠悠爬了起来，他挖掘着身边的沙子，可是却以不可抗拒的趋势陷落下去。沙人掉落到一个与之前十分类似的世界，所不同的是大地上铺满了白色纸张，纸随风飘散，不知何往。沙人发现某处有水低落，当他仰头观望时，脚下的土地再度塌陷，他掉到了一个长满石头的荒凉世界。水似乎成为他执着追寻的目标，他追逐，他失败，他又再度爬起，一遍一遍，没有止息…… 本片荣获1997年第69届奥斯卡最佳动画短片奖。
很多年前，银河系另一端的两颗行星被黑洞所吞噬，两个尚在襁褓中的外星孩子乘坐飞行器来到地球。拥有超能力的他们在截然不同的环境中长大，也造就了各自不同的性格和人生走向。长大后，仪表堂堂、正气凌然的成为了保...
《恋离飞翼》剧情紧接着《虚空歌姬》，时间大约为第一部完结之后1个月，故事描述了主人公早乙女阿尔特他们与不明宇宙生物“Vajra”之间最后的战役。对于很多fans有所不满的“双飞”恋情，在本作中也将画上句号。阿尔特将在两位女主角——雪莉露·诺姆和兰卡之间做出一个选择。《剧场版 MacrossF》在当初制作时就预备做成上下两部，所以这部剧场动画也是《MacrossF》整个故事的完结篇。 西历2059年，计划寻找新天地的银河移民船团“macross frontier”上，一名以驾驶员为目标而努力的少年早乙女阿尔特感受到了前所未有的闭塞感。这个时候，位于银河顶端的歌姬雪莉露·诺姆来到船团举行巡回演唱会，阿尔特以及憧憬着雪莉露的少女兰花·李当天都来到了会场。 然而演唱会当中，却突然遭到重机架生命体的袭击。为了保护少女们，阿尔特登上了最新型可变战斗机VF-25。在战火烽烟的尽头，传说中可以震撼宇宙的“歌”以及纠缠着少女们的“迷”究竟是什么……？
改造实验帝国梅斯强夺了一群流浪小动物，改造成了新的怪人。闪光人意外发现怪人体内有一条狗妈妈的基因，而当它见到自己的孩子时就会停止攻击。一开始闪光人试图借助小狗逃避战斗，但在红闪光的劝说下，全员还是决定保护小狗，迎战怪人……
